南京农业大学发布迄今世界最大植物基因组—兰州百合基因组,36.68 Gb!
本研究利用Nanopore、Illumina和Hi-C测序技术,以及优化的组装方法,获得了36.68 Gb的兰州百合(Lilium davidii var. unicolor)超大型基因组,并解析了其形成机制和特征,也揭示了鳞茎营养物质积累的遗传基础。这一成果标志着百合的分子研究进入新时代,也是植物基因组学的重要突🈹破(pò)性(xìng)研(yán)究(jiū)进(jìn)展(zhǎn)之(zhī)一(yī)。论(lùn)文的(de)主要(yào)研(yán)究(jiū)内(nèi)容(róng)具(jù)体(tǐ)如(rú)下(xià): 1. 超(chāo)大(dà)基(jī)因(yīn)组(zǔ)的(de)染(rǎn)色(sè)体(tǐ)水(shuǐ)平(píng)组(zǔ)装(zhuāng) 流(liú)式(shì)细(xì)胞(bāo)实(shí)验(yàn)和(hé)K-mer分(fēn)析(xī)预(yù)估(gū)兰(lán)州(zhōu)百(bǎi)合(hé)基(jī)因(yīn)组(zǔ)的(de)预(yù)估(gū)大(dà)小(xiǎo)分(fēn)别(bié)为(wèi)38.01 Gb和(hé)3。

全球(qiú)首(shǒu)个(gè)血(xuè)橙(chéng)高(gāo)质(zhì)量(liàng)基(jī)因(yīn)组(zǔ)发(fā)布(bù)
全球(qiú)首(shǒu)个(gè)血(xuè)橙(chéng)高(gāo)质(zhì)量(liàng)基(jī)因(yīn)组(zǔ)发(fā)布(bù)5月(yuè)19日(rì),重(zhòng)庆(qìng)市(shì)农(nóng)科(kē)院(yuàn)发(fā)布(bù)消(xiāo)息(xi),该(gāi)院(yuàn)果(guǒ)树(shù)所(suǒ)柑(gān)橘(jú)创(chuàng)新(xīn)团(tuán)队(duì)杨蕾、洪林、王敏、李霜等研究人员发布了国际首个血橙高质量基因组。相关研究成果以学术论文近日在国际期刊《科学数据》发表。杨蕾介绍,血橙是一种极具特色的甜橙品种,具有较高的花青素含量,其含有的多种成分对人体健康有益。目前,国内血橙主要在川渝地区种植,总种植面积超过100万亩,其中重庆有40万余亩。然而,现主栽血橙品种存在品质不稳定等问题。? 血橙果实和基因组框架图。重庆市农科院供图 该团队开展自主。
Plant Cell | 草莓的驯化和育种史
02🐸Kaiyun中国 科学问题 最初的杂交和随后草莓品种对不同气候的适应如何塑造了现代育种种群的遗传组成?育种过程中使用了哪些野生种/亚种?我们能否识别出与重要农艺性状相关的基因组区块,以及它们是否受到选择? 03 研究发现 通过分析289个草莓品种的全基因组序列,我们确认在现代品种中弗吉尼亚草莓的祖先比例比初始杂交品种增加了20%,而智利草莓太平洋亚种的比例从0增加到了3.4%。地中海(加州)和亚热带(佛罗里达)气候的趋异进化导致两种草莓在28条染色体中的21条上差异选择。我们还发现了16。
草莓领域又一篇Plant Cell,华中农业大学博士后揭示草莓花器官形成的分子机制
综上所述,该研究🍭Kaiyun中国通过正向遗传学方法挖掘了森林草莓AP2转录因子BRE,发现该基因直接调控生长素路径多个基因的转录水平,影响生长素稳态和信号输出,进而调控花器官形成。该基因的功能研究揭示了生长素途径在草莓花器官尤其是心皮发育中的关键作用,有助于完善植物生殖器官发育调控网络。博士研究生胡少强、已毕业博士生冯佳、美国马里兰大学及深圳理工大学刘重持教授参与了本研究。华中农业大学植物科学技术学院戴成副教授为本(běn)研(yán)究提供了指导,梁珊为本研究模式图绘制提供了帮助。该工作得到了国家重点研发计划。
科学家为红颜草莓组装八倍体基因组,助推草莓遗传学研究和育种改进
为了解决上述问题,同时促进草莓的基因鉴定和育种改进,近期中国农业科学院郑州果树研究所和中国农业科学院深圳农业基因组研究所等团队,为红颜草莓组装了一个高质量、无间隙的八倍体基因组,并对该品种亚基因组之间 DNA 甲基化的变化进行分析。该课题组先将红颜草莓的 4 个亚基因组,与现有的二倍体基因组的全基因进行比对,从而揭示出八倍体草莓的 ABBxB🏆x 基因组结构。然后,他们又对亚基因组结构、重复序列和 DNA 甲基化进行比较分析,发现亚基因组 A 占据主导地位,而其他 3 个亚基因。










