Nature Methods | 肿瘤进化的空间图谱：CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
等位基因计数矩阵 (Y0)：记录来自于生殖系杂合 SNP 的非参🈵开云·Kaiyun网页版考等位基因的读数。总等位基因计数矩阵 (D0)：包括来自于参考和非参考等位基因的总读数。这些矩阵通常通过标准的 SRT 分析管道得出，其中(zhōng) Y0 和(hé) D0 是(shì)通(tōng)过(guò)专(zhuān)门(mén)的(de)管(guǎn)道(dào)计(jì)算(suàn)得(de)出(chū)的(de)，针(zhēn)对(duì)已(yǐ)知(zhī) SNP 位(wèi)点(diǎn)进(jìn)行(xíng)等(děng)位(wèi)基(jī)因(yīn)计(jì)数(shù)。2. 初(chū)步(bù)相(xiāng)位(wèi) 初(chū)步(bù)步(bù)骤(zhòu)包(bāo)括(kuò)使(shǐ)用(yòng)参(cān)考单倍型数据库通过基于人群的算法（如 Eagle2）对 SNP 进行相位。这种相位通常对邻近 SNP 可靠，但在远离 SNP 的情况下可能存在错误。
【国科科技港】我国水稻研究领域再发Science
遗传背景不同导致基因效应差异特定等位基因的表型经常受到遗传背景的影响,相同的等位基因可能在一种遗传背景中有效,但由于上位性掩蔽效应造成在另一种背景中变得无效。根据双QTL组合之间的表型差异模式,研究发掘到了170个掩蔽型互作对(图🌲6A),未发现符号型互作对(不同基因组合中遗传效应的方向相反)。对于每个掩蔽型互作对,掩蔽基因被视为导致背景效应的基因,而另一个基因是被掩蔽的基因。我们确定了170对中每一对的掩蔽等位基因。基于这些等位基因的信息,进一步对404个具有全基因组序列的水。
硕士生在Plant Physiol发文，建立双亲图表征、分析杂交植物基因组的新方法
双亲图基因组大大提升了杂交种重测序和RNA-seq数据比对的效率⭐️和准确性，且能更加无偏的估计等位基因在父母单倍型间表达量的剂量效应（图2），有望广泛应用于基因印记、杂种优势等相关研究。图2: 利用线性和图形基因组鉴定等位基因特异性表达基因 史俊鹏副教授课题组聚焦玉米和近缘种的比较基因组和染色质组学研究，课题组成立以来以第一和通讯作者（含共同）在Nat Genet (2025)、Mol Plant (2025)、Plant Physiol (2025)、Plant Com (2。
获世卫组织确认命名，四川新发现31个HLA等位基因
附被命名的31个人类白细胞抗原（HLA）等位基因：C*03:686、A*11:473、C*03:687、DRB1*04:383、B*40:06:33、C*14:166、B*40:582、A*11:01:131、DRB1*14:02:12、C*0🎭开云·Kaiyun网页版1:275N、DRB1*11:04:24、B*40:583、DPB1*1497:01、C*15:282、A*02:07:24、C*07:1150、C*03:685、C*03:04:111、C*03:04:110、DPB1*1629:01。
百元寿司郎，吊打高端日料
寿司郎用一套高效的工业化体系，碾压了那些故弄玄虚的「匠人叙事」，回归了一种本该如此的「商业常识」。 去年北京寿司郎西单大悦城店开业，排队直冲1700多号 ，有人硬等10个钟头，非要吃上这顿寿司。 这两年，寿司郎在全国各地的门店，从天津到珠海，基本上都需要排队等位。黄牛们更是嗅到了商机，一个排队号能炒到几十上百块，甚至专门开发出了山寨版的官方小程序，来以假乱真。 所以，这个寿司郎到底是什么来路，为什么一个人均150的寿司店，就能让大家心甘情愿排队？ 这期内容，我们就来聊聊寿司郎。
Pycard 基因敲除小鼠
